广西兽医研究所领导的一项流感监测新研究表明,中国的活禽市场有时是低致病性禽流感病毒(LPAIV)的寄居地,这些病毒不会对禽类造成明显伤害,但可能导致人类爆发严重的疾病。这项成果近期发表在《Scientific Reports》上。
在2012-2015年期间,研究人员从广西多个活禽市场的鸡、鸭和鹅中采集了3,800多个拭子样本,并对甲型流感病毒开展了测序。他们的分析表明,根据流感病毒血凝素蛋白(HA)的抗原特征,大约16%的样本包含低致病性禽流感病毒,至少有六种亚型:H1、H3、H4、H6、H9或H11。
有意思的是,研究人员还发现,鸭经常携带H3亚型的流感病毒,鹅往往携带H6亚型流感病毒。而H9流感病毒在鸡身上最常见。不过,超过四分之一的LPAIV阳性样本含有不止一种亚型的流感病毒,这为病毒重排和重组创造了环境。
过去,低致病性禽流感病毒在全球疾病控制项目中往往被忽视,因为它们很少在家禽或其他鸟类中引起疾病。不过,研究人员指出,LPAIV的遗传重排和重组有很大机会造成快速且明显的病毒改变。这些改变有可能产生毒力增强的新病毒,对家禽和人类健康造成严重威胁。
在这项监测研究中,研究人员从广西21个活禽市场的鸡鸭鹅中采集了3,813个口咽和泄殖腔拭子样本。他们利用病毒分离、血凝抑制分析和病毒测序,确定了622个拭子样本中带有低致病性禽流感病毒:161个鸡样本、402个鸭样本和59个鹅样本。他们指出,在处理鹅样本时,LPAIV的分离是最成功的。
研究人员报告称,LPAIV阳性组包含了六种已知的HA亚型以及一些未知的HA亚型。其中,160个样本存在不止一种HA亚型的混合感染。143只禽类携带了两种HA亚型的LPAIV,而十几只禽类至少携带三种亚型。更甚的是,一只鸭子携带了六种HA亚型。
“不同HA亚型在同一只禽类上的共同感染带来巨大的基因重排风险,这可能导致新的禽流感病毒亚型产生,”作者写道。“此外,通过不同来源的病毒之间的重排,混合感染增加了病毒多样性。”
这项研究表明低致病性禽流感病毒在这一地区的家禽中广泛流行,它的遗传学和进化需要进一步的研究。目前,研究团队已经将血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因的序列提交给NCBI的BLAST数据库。
Surveillance of Live Poultry Markets for Low Pathogenic Avian Influenza Viruses in Guangxi Province, Southern China, from 2012–2015
Abstract
Infections with low pathogenic avian influenza viruses (LPAIVs) can be mild or asymptomatic in poultry; however, in humans, LPAIVs can cause severe infections and death, as demonstrated by the H7N9 and H10N8 human infection outbreaks in 2013 in China. In this study, we conducted an epidemiological survey of LPAIVs at live poultry markets (LPMs) in Guangxi Province, Southern China, which is near several Southeast Asian countries. From January 2012 to December 2015, we collected 3,813 swab samples from poultry at LPMs in Guangxi. Viral isolation, hemagglutination inhibition assay and viral sequencing were utilized to identify LPAIVs in the collected samples. Among the samples, 622 (16.3%) were positive for LPAIVs. Six subtypes (H1, H3, H4, H6, H9 and H11) were individually isolated and identified. Of these subtypes, H3, H6 and H9 were predominant in ducks, geese and chickens, respectively. Among the 622 positive samples, 160 (25.7%) contained more than one subtype, and H8, H10, H12, H13, and H16 were identified among them, which highlights the continuous need for enhanced surveillance of AIVs. These results provide detailed information regarding the epidemic situation of LPAIVs in the area, which can aid efforts to prevent and control AIV transmission in humans and animals.
(原标题:Scientific Reports:聚焦广西活禽市场低致病性禽流感病毒流行概况)