在9月12日的一次大学网络研讨会上，来自明尼苏达大学的兽医学博士Tim Johnson表示，随着病原菌检测技术的进步，高分辨率的分型能够帮助应对农场上的细菌疾病。
Johnson博士说，对病原菌分型通常有4种方法：
1.血清分型，低分辨率表型
2.毒力基因分析，低分辨率基因型
3.指纹法，中低分辨率基因型
4.DNA测序，高分辨率基因型
他说，所用方法的分辨率越高，从分型中获得的信息就越多。通过DNA测序，家禽农场经营者可以更好地选择疫苗株，或者将病原菌从一个环境连接到另外一个环境。
为何关注治病之外的细菌病原体？
Johnson称，即使没有疾病发生，病原量也和禽只的性能存在关联。这就是为什么用疫苗鉴别所靶向的正确病原体如此重要。
因为市场上没有鼻气管鸟疫杆菌（ORT，一种可以导致家禽呼吸道疾病的细菌）的疫苗，我们必须使用农场上发现的菌株来创造出这样的疫苗。
理论上讲，经营者可以选择一个能够代表特定鸡群的菌株，以此生产出一种可以抵御这种菌株的疫苗，然后给禽只接种。但是，Johnson博士说，长期不变地使用一种疫苗的问题在于，病原体的类型会发生变化。
“创造出一种疫苗，希望它能永久有效不是一个好的想法，”他说。“你需要基因组测序/分型，需要进行监测以了解随着时间的推移出现的变化以及什么时候需要转向新的菌株来生产疫苗。”
Johnson博士概括了成功的疫苗接种方案的6个工作流程：
1.对农场上的菌株进行广泛的监测
2.确定优势问题株
3.创造一个以这些菌株为靶向的有效自体疫苗
4.继续监测这些菌株
5.对下一个疫苗组合做出预测
6.每1-2年更换疫苗株
“如果这些步骤没有连贯起来就不会产生效果，而且如果你的分型方法分辨率低的话同样也不会奏效，”Johnson 博士说。
