目前，欧洲猪场废气净化多数已采用生物处理设备。VOCs废气生物处理工艺最早兴起于荷兰和德国，尤其适用于中、低浓度废气的处理。猪舍排出的气体具有低浓度，大流量特点，因此更适合采用生物处理工艺、生物法原理主要是利用微生物代谢活动，将VOCs转化为细胞代谢的能源、细胞组成物质及无害的小分子物质（如水、二氧化碳等）。
优点：反应条件温和、设备简单、操作方便、运行费用低，二次污染小
局限：其生物降解速率有限，承受负荷不能过高。
生物处理工艺目前有四种，生物过滤、生物滴滤、生物洗涤、膜生物反应器等4中净化工艺。用于猪舍排气净化比较成熟且采用最多的是生物过滤和生物滴滤的方式。
1. 生物过滤
早期的猪舍排气生物过滤工艺比较简单（见图片）
目前，生物过滤处理工艺更加标准化、规范化，处理结果也更加稳定。单级的生物净化器处理原理见下图
通过风机排出的猪舍废气先经过预处理（加湿），进入到压力室，通过有机过滤材料6净化后再排入大气。有机过滤材料需要间歇喷水加湿，水池位于设备底部，由喷淋泵输送到设备上部的喷淋装置。水池根据消耗量及时补充清水，同时还要将污水浓度超标时排除。
这种猪舍用的生物过滤系统，对粉尘和气味的净化效果突出，但对于氨的处理并不十分理想。通过过滤器的氨主要和微生物发生的是硝化和反硝化过程，即有氧条件下，经亚硝酸细菌和硝酸细菌的硝化作用转为硝酸，在兼性厌氧条件下，硝酸盐还原细菌将硝酸盐还原为氮气。
硝化：NH3+O2→HNO2+H2O
HNO2+O2→HNO3+H2O
反硝化：HNO3→HNO2→HNO→N2O→ N2
其中硝化作用产生的亚硝酸盐和硝酸盐会滞留在有机填料上，这会使填料的PH值降低，当PH值＜4时，会导致亚硝气体的释放，这些气体是会让人感觉出熟悉的游泳池气味，这样氨氮在这种情景下释放，会影响后面的氨氮沉积。因此必须定期更换填料，维持过滤系统正常工作。
生物过滤处理工艺采用的填料可以是木屑、花生壳、玉米棒芯、树根、树皮等，物料的不同，填料更换的时间1年到5年时间不等。
生物过滤处理的优点：设备简单，气味去除效果最好，运行成本低，承载负荷大。
生物过滤处理的缺点：处理过程不易控制，氨处理能力差，占用空间大，定期需要更换填料。
