1、猪舍严格按照饲养的工艺流程来进行安排，如配种舍(种公猪和空怀母猪)→妊娠舍→分娩舍→仔猪保育舍→生长猪舍→育肥猪舍。种猪舍位于上风向，育肥猪舍位于下风向，(注意观察当地经常性风向)。地形选择基本原则是要求地势高，地下水位低，地势开阔，通风光照好。要求选择通风透光性好，干燥卫生，操作管理方便，南方地区注意防潮防热和排水，北方地区注意保暖通风防雪等，沿海地区注意防风。坐北朝南，根据不同地方特点略有偏差。
2、注重舍内通风与换气，必要时可以装电动排风扇，注意排风扇是吸收外面的空气外里面吹，实践证明这种方法换气速度快、节省换气电能。
3、猪舍的走向，尽量与夏天最多的风向平行，以使风能从猪舍中纵向通过。
4、发酵床养猪冬天容易保温，夏天则要注意防暑降温，如顶部要用不透光和反光的遮阳布，同时为了防止早晚斜阳照射引起温度过高，在猪舍的东西两面，特别是西面，使用帘布或黑篷布遮阳，也可以种植阔叶树木。
5、发酵床的建筑可以尽量简单化，可以使用大棚式猪舍，例如建造一个150平方米左右的面积，养猪规模100头的育肥猪的养猪大棚，只需投资1万元左右，如果使用旧猪栏改造成本就更低。
6、发酵床养猪猪舍也可以在原建猪舍的基础上稍加改造就行，一般要求猪舍充分采光、通风良好，南北可以敞开，建议通常每间猪圈净面积至少20平方米(可根据具体情况调节，但建议猪舍以不低于10平方米为宜，母猪栏可以适当缩小)，每20平方米面积可饲养肉猪15头左右，朝南面的中部具有可自由开闭的窗子，这样可使猪舍内部的微生物更适宜地生长繁殖，利于发酵。
