临床上，可以引起母猪急性死亡最常见的疾病有以下几种，包括非洲猪瘟、经典猪瘟、严重的胃溃疡（穿孔）、急性的细菌性败血症（如B型诺维氏梭菌、猪丹毒）、饲料的的霉菌毒素超标等，此外猪放线杆菌引起的猪泌尿系统感染也可以引起母猪的急性死亡。
脾脏是参与免疫反应的重要的外周免疫器官，又是血液的过滤器，是机体参与病原斗争的主战场，所以在病原微生物全身感染的时候，脾脏会出现严重的反应，图中的脾脏属于急性脾炎，比正常的脾脏要肿大数倍，在猪的疾病中，可以引起急性脾炎的疾病，最常见的有非洲猪瘟、经典猪瘟、以及猪急性的细菌性败血症（这其中可以包括多种细菌如链球菌、诺维氏梭菌等），根据脾脏的大体病变，我们重点关注的就是非洲猪瘟、经典猪瘟、以及猪细菌性败血症。猪蓝耳病以及猪圆环病毒在脾脏通常并不能形成非常有说服力的大体病变，圆环病毒一般引起肉芽肿性脾炎，但是这种脾炎通常只有在显微镜下才能观察到，脾脏会有一些肉芽肿性病变。
胃溃疡，是指急性消化不良与胃出血引起胃黏膜局部组织糜烂、坏死或自体消化，从而形成圆形溃疡面，甚至胃穿孔。在非洲猪瘟到来之前，胃溃疡是中国母猪的头号杀手，需要值得特别注意的是，发生在食道口贲门附近的胃溃疡，才具有证病性意义，胃其他部位的位置发生溃疡并不具有这种意义，上图中的胃，并没有见到溃疡性的病变，因此我们可以排除掉母猪急性死亡的原因是胃溃疡。
左下图组织是肝脏，肝脏呈蜂窝状，充满各种小气孔，呈泡沫状结构，泡沫肝病变是母猪诺维氏梭菌的特征性的解剖病变，很难分析梭菌是如何逆行到达肝脏，引起肝损伤。
我们可以通过分子生物学排除非洲猪瘟，经典猪瘟。可以引起母猪急性死亡的细菌性疾病有很多，比如猪丹毒、猪传染性胸膜肺炎放线杆菌、诺维氏梭菌等。但是细菌性疾病同样会有不同的入侵部位以及损伤特点，比如猪传染性胸膜肺炎除了可能会引起急性脾炎的病变，更重要的是会引起坏死性出血性肺炎，猪丹毒丝杆菌会引起广泛的皮肤的病变。肝脏的大体病变为具有指向性，泡沫肝一般是猪诺维氏梭菌的典型病变，我们进一步通过根据微观病变我们可以确定引起母猪急性死亡的为梭菌，细菌分离鉴定的结果证实为为诺维氏梭菌。
在这个案例中，可以灵活运用多种手段，比如肝脏涂片，正常的肝脏是不能看到任何细菌的。一旦看到细菌，并且解剖病变可以看到泡沫肝样病变，这时候基本就可以确定是梭菌性疾病了。进一步的验证手段可以把肝脏做HE染色，在肝组织可见到大量的梭状芽孢杆菌。因为其他的细菌性疾病难以形成这样的病变，细菌培养并不是必要性的，因为猪诺维式梭菌是最难培养到的细菌之一。
需要了解每种疾病的损伤特点以及损伤部位，比如猪流行性腹泻病毒最主要的攻击部位是小肠绒毛的上皮细胞，除此以外的肺、心脏、肝脏、等部位并不是损伤范围，细菌的侵入必须依赖严格的侵入渠道，例如破伤风梭菌只能经过带有杂质的深部感染，并且局部必须是有坏死或者化脓性变化，其他渠道进入的则不发生感染。 传染性胸膜肺炎 APP更容易发生于流感和伪狂犬的猪场，因为这些病毒会更容易破坏气管的上皮细胞，这些损伤会使得APP更容易突破肺的防疫系统，定植于肺泡。兽医只有了解每种疾病的器官损伤特点，然后再结合分子生物学、微生物学等实验室检测手段，这样才是真正意义上的疾病诊断。
