近日在哈尔滨市召开的“国际首例猪T2T全基因组组装——民猪完整基因组构建”成果发布会上,由国内5个科研团队基于三代测序、ONT、Hi-C等前沿技术完成的猪T2T全基因组组装——民猪完整基因组构建成果,填补了猪T2T基因组组装领域的空白,为猪遗传育种和功能基因挖掘提供了高精度“蓝图”,标志着猪基因组研究迈入“完整解析”新时代,成果达到国际领先水平。
这5个团队包括中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员团队、黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员团队、重庆市畜牧科学院王金勇研究员团队、岳麓山实验室印遇龙院士团队和四川农业大学李明洲教授团队。发布会上,刘娣代表5个团队进行了成果发布。专家组经过集中讨论,最后提出综合评价结论。大家一致认为,该成果不仅实现了猪基因组研究的里程碑式突破,更在应用层面展现出多重优势:在基因组完整性方面为猪遗传多样性研究、进化分析及疾病抗性基因挖掘提供完整参考;SV标记的应用显着提升基因组选择的效率,加速优良性状定向改良,实现精准育种;冷适应基因的发现为环境适应性育种开辟新路径,助力养殖业提质增效,提高产业适配性。
刘娣介绍,这一研究成果有四大特点。一是基因组最完整,填补了国际空白。二是泛基因组最全面。三是发现了89个与冷适应相关的候选基因,通过整合SV与RNA测序分析,进一步锁定17个与结构变异直接关联的冷适应基因。四是育种应用方面取得新突破,育种准确度显著提升。此外,团队通过精细定位发现调控猪体型的关键基因组区域CL3及核心SV位点,为高效选育优质种猪提供了新策略。
中国工程院院士、中国科学院亚热带农业生态研究所研究员印遇龙认为,用传统技术育种至少要经过5个世代,应用新技术后,可以缩短育种进程。这一成果对指导猪的生物育种,尤其是地方猪的生物育种具有非常重要的意义。